Siemen sisältää alkion, jossa ovat uuden kasviyksilön juurien, verson ja ensimmäisten lehtien alut. Siemen itää, kun olosuhteet suosivat kehitystä.
Eri kasveilla on erilaisia vaatimuksia sen suhteen, millaisissa olosuhteissa niiden siemenet itävät. Yleensä vedellä on suuri merkitys itämiselle. Tärkeitä tekijöitä ovat myös lämpötila ja hapen ja valon määrä. Monien kasvien siemenet itävät parhaiten, kun on kosteaa, lämmintä ja pimeää.
Alkiota suojaa siemenkuori, joka koostuu yleensä emokasvin kovasta solukosta. Siemenet sisältävät tavallisesti siemenvalkuaista, joka koostuu tärkkelyksestä, öljystä ja proteiinista.
Kun siemen imee itseensä vettä, siemenvalkuainen pilkkoutuu aineiksi, joita alkio käyttää ravinnokseen alkaessaan kehittyä.